I House of Shinobi har år gått siden den siste store Shinobi -krigen ødela hjemlandet ditt. Nå går du inn i hovedpersonens rolle og deler et hjem med din utleier og romkamerat når Shinobi -verdenen skifter mot imperialistisk styre.
Men hva skjer når du plutselig får kraften eller begrunnelsen til å handle på vilkårene dine? Forge din skjebne i en verden som konsumeres av blodsutgytelse og konflikt. House of Shinobi er et valg av valg, vil du stige som beskytter av de du holder kjære, eller vil du gå ned i syklusen av hevn og ødeleggelse? Skjebnen til Shinobi -verdenen er din å forme.